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染色體作為遺傳物質(zhì)的載體，在細胞中不是隨機分布的。近年來，越來越多的研究開始關(guān)注染色體的空結(jié)構(gòu)。大量證據(jù)表明，染色體構(gòu)象與基因表達、DNA復(fù)制、DNA損傷修復(fù)和基因組穩(wěn)定性密切相關(guān)。

Hi-C是近年來發(fā)展起來的研究三維基因組學(xué)的利器。它來源于高通量測序技術(shù)和染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)的結(jié)合，用于染色體構(gòu)象的分析。

然而，由于構(gòu)建一個高-C庫需要將近一千萬個細胞，這& ldquo遙不可及。數(shù)據(jù)庫的初始量極大地限制了生殖和腫瘤研究領(lǐng)域中微量樣品的染色質(zhì)構(gòu)象分析和研究人員對未知領(lǐng)域的探索。

因此，減少Hi-C數(shù)據(jù)庫構(gòu)建的初始量一直是3D基因組學(xué)研究者想要解決的難題。

率先減少高-C技術(shù)建立數(shù)據(jù)庫& ldquo閾值& rdquo

最近，3D基因組測序技術(shù)的領(lǐng)導(dǎo)者& mdash& mdash安諾基因成功推出10萬細胞級別的Hi-C數(shù)據(jù)庫，率先實現(xiàn)了Hi-C數(shù)據(jù)庫低初始量的產(chǎn)業(yè)化服務(wù)，使Hi-C技術(shù)應(yīng)用到更多的研究領(lǐng)域。以下內(nèi)容來自此& ldquo升級版本& rdquo高-C技術(shù)的一些測量數(shù)據(jù):

樣本要求。

樣本類型:細胞(人、小鼠或其他物種)。

文庫構(gòu)建初始量:100，000個交聯(lián)細胞樣品/文庫(約3ug DNA)。

測序平臺:Illumina Hiseq X TEN，PE150。

測得的小數(shù)據(jù)結(jié)果。

10余個人鼠細胞樣本經(jīng)過多輪測試，小數(shù)據(jù)評估結(jié)果顯示，可用于分析的效度(%)在60%以上，最高為83%。

(1)某些人體細胞樣本的結(jié)果顯示。

(2)一些小鼠細胞樣本的結(jié)果顯示。

測量的大數(shù)據(jù)結(jié)果。

隨機測試2個人體細胞樣本的大數(shù)據(jù)，分別統(tǒng)計大數(shù)據(jù)的有效比對率和有效數(shù)據(jù)率，符合分析要求。結(jié)果如下:

(1)有效比較率統(tǒng)計。

(2)有效數(shù)據(jù)率統(tǒng)計。

交互式熱圖結(jié)果顯示。

分析小數(shù)據(jù)結(jié)果的交互熱圖。如下圖所示，顯示全基因組Hi-C的交互熱圖。

仍在升級Hi-C技術(shù)。

Anuo Gene于2015年初在國內(nèi)率先推出動物種群Hi-C和單細胞Hi-C測序服務(wù)，隨后將人類染色體三維構(gòu)象分辨率提升至1kb級別；同年12月，公司在國內(nèi)首次推出了植物Hi-C測序服務(wù)。

四年來，隨著技術(shù)的不斷提高，很多科學(xué)家利用Anuo基因的Hi-C技術(shù)發(fā)表了自己的研究成果。公司與法國居里研究所、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國科學(xué)院動物研究所、西南大學(xué)、南京醫(yī)科大學(xué)等科研院所達成深度合作，部分成果在《自然》、《分子植物》、《自然通訊》、《基因組生物學(xué)》等期刊發(fā)表，累計of 97.19。

Anuo基因表明，10萬個細胞的產(chǎn)業(yè)化是微細胞Hi-C研發(fā)計劃的關(guān)鍵進展，但這還遠未達到終點，持續(xù)降低Hi-C初始量的研發(fā)仍在繼續(xù)。Hi-C技術(shù)的進一步升級將擴大其應(yīng)用范圍和用戶，有助于克服生命科學(xué)領(lǐng)域更多未解決的問題。